Sejak awal Yayasan Kusuma Buana telah melibatkan diri dalam kegiatan penelitian dan pelatihan untuk membantu Pemerintah Indonesia dalam upaya peningkatan kualitas masyarakat madani. Berbagai jenis penelitian telah dilaksanakan bekerja sama dengan institusi terkait baik dari perguruan tinggi, organisasi profesi, maupun dari instansi pemerintah seperti Kemenkes, BKKBN, Kemendikbud, dan Kemenaker. Penelitian-penelitian juga dilaksanakan Bersama dengan organisasi internasional yang berbasis pemerintahan maupun yang berbasis swasta.

Penelitian di bidang kependudukan mengenai introduksi metoda kontrasepsi baru, evaluasi keamanan kontrasepsi, penjagaan mutu alat kontrasepsi, Kesehatan reproduksi remaja telah banyak dilaksanakan bekerja sama dengan institusi internasional, maupun nasional. Lembaga internasional yang telah memberikan dana penelitian terkait antara lain USAID, UNFPA, WHO, Canada, John Hopkins, URC, FHI, John Snow, Global Fund, ICOMP, EMpower. Lembaga nasional mencakup BKKBN dan Kemenkes, selain Departemen Kebidanan dari berbagai perguruan tinggi di Indonesia, POGI, IDI, IBI, serta beberapa perusahan farmasi seperti PT Triyasa Naga Mas.

Penelitian mengenai masalah IMS, HIV, TB bekerja sama dengan ILO, UNAIDS, Kemenkes, KPAN, PMI, PPTI. Khusus untuk kegiatan yang berbasis tempat kerja telah dilakukan Kerjasama dengan Kemenaker, APINDO, Serikat Buruh Indonesia, HAZAMA, AUSAID. Penelitian yang berbasis sekolah mengenai infeksi parasite, anemia, dan masalah sanitasi dilakan melalui Kerjasama dengan Aramco, JOICF, HOPE International, dan beberapa perusahaan farmasi terkait.

Program pelatihan juga telah diselenggarakan oleh Yayasan Kusuma Buana bekerja sama dengan BKKBN. YKB merupakan salah satu Lembaga yang dilibatkan oleh BKKBN sebagai pelatih dalam program PULIN (Pusat Pelatihan Internasional) yang memberikan pelatihan bagi pengelola program Keluarga Berencana dari berbagai negara sahabat. YKB sendiri juga menyelenggarakan program pelatihan mengenai layanan Kesehatan reproduksi mandiri bagi LSM-LSM internasional dengan bantuan dana dari PathFinder, Joicfp, dan ICOMP. Selain itu YKB juga memberikan pelatihan bagi bidan praktek swasta yang menjadi anggota IBI DKI Jakarta. Program pelatihan bagi guru, Peer educator dikalangan siswa, pekerja pabrik juga diselenggarakan oleh YKB.